▲ 福尔多（Fordow）地下核设施遇袭后的卫星影像，摄于6月24日。
以色列对伊朗核设施的攻击传出最早自2010年就开始部署，英媒取得的文件显示，以色列情报机构摩萨德（Mossad）多年来早已渗透伊朗境内，深入飞弹与核计画核心，掌握远比外界认知更庞大的军备资料，成为近期多起精准打击关键依据。
《泰晤士报》取得以色列与美英等盟友共享的外泄情报文件指出，伊朗核武发展早已超出外界想像，不仅限于福尔多（Fordow）、纳坦兹（Natanz）及伊斯法罕（Isfahan）3大基地。而知情人士向该报透露，摩萨德早已在多处部署人员，长期监视、搜集资料，并在发动攻击前完成地面布局、确认目标。
以伊12天冲突期间，以色列锁定德黑兰及伊斯法罕3处用于生产浓缩铀离心机的设施发动空袭，并集中打击纳坦兹设施中的7个关键系统，根据地面间谍绘制的地下设施分布图，攻击电力、研发中心、通风冷却管线等设施，可见渗透程度极深。
除纳坦兹以外，以色列打击伊斯法罕、努尔（Nur）与莫格德（Mogdeh）等地核子研究机构与军事基地，甚至摧毁用于测试核武的塑胶炸药制造设施，这些据点多由已故科学家法克里札德（Mohsen Fakhrizadeh）主导。以色列还声称曾渗透伊朗革命卫队总部与其他敏感地点，指出伊朗核武研发已进入实验阶段。
摩萨德早在2010年就被指涉入暗杀一名伊朗科学家，2024年更透过雇用伊朗保全，在德黑兰装设爆裂物刺杀哈玛斯领袖哈尼雅。据报以色列情报单位几周前甚至提出暗杀最高领袖哈米尼（Ayatollah Ali Khamenei），但被美国总统川普反对，川普27日也发文称自己「救了他一命」。
根据以色列情报，伊朗计画每月生产数十枚长程地对地飞弹，每年生产上千枚，目标达成8000枚库存，而13日冲突爆发前已拥有约2000至2500枚。伊朗境内以色列间谍事先实地前往各大飞弹生产与研发设施，包括用于制造碳纤维弹体的里海沿岸工厂，并成功将其摧毁。而冲突过后德黑兰大举清查，逮捕数十名间谍嫌疑人，也显示对内部渗透的疑虑。
以色列多年来对伊朗的监视与打击，已成为情报作战的经典案例。英国海法大学研究中心主任索弗（Efrat Sopher）表示，摩萨德在成功打击伊朗威胁方面发挥关键作用，对伊朗及其代理人的成功行动将写入历史。伊朗外长阿拉格奇26日也坦承，以色列与美国的行动对伊朗核计画造成「过度且严重破坏」。
