中共中央纪律检查委员会副书记、监察部部长兼国家预防腐败局局长马馼3月3日下午在全国政协开幕会后披露的铁道部原党组书记、部长刘志军案件最新进展—— “进入司法程序还有一段时间”——引起外界关注。大陆媒体也纷纷报道。但香港英文报纸《南华早报》4日报道援引马馼3日在政协开幕第一天的话说“王立军案不是由中纪委处理(‘No, he does not fall under the jurisdiction [of the Central Commission for Discipline Inspection]’)”、她还没有收到关于王立军案“官方通知”(Ma also said she had not received any “official notice” on Wang’s case)。但是，几乎没有大陆媒体报道过马馼的这段话。
《南华早报》的报道还说，马馼关于王立军事件的这番评论(comments)让王立军是被中国国家安全部门调查的传言更可信。早前，官方新华社2月9日深夜发布通稿称“王立军于2月6日进入美国驻成都总领事馆，滞留1天后离开。有关部门正在对此进行调查。”但官方并未透露是哪个部门介入调查的信息。随后有大陆网友上传一张电子机票，其中显示王立军 8日乘坐早上8时的班机从成都飞往北京，同行者有国家安全部副部长邱进。虽然该消息未获证实，不过外界普遍认为王立军被国家安全部门带走调查。
重庆市政府发言人3月5日透过重庆官方华龙网称，“据我所知，王立军目前正在接受国家有关部门的调查，调查工作也取得了进展，经过国家有关部门全面深入调查后，中央将会严格依纪、依法作出处理。”到底是哪个部门在调查王立军的信息还是阙如。但两会召开前的2月28日，重庆市市长黄奇帆接受已落地大陆的香港媒体凤凰卫视采访时首次证实王立军在美国驻成都总领事馆出来之后被国家安全系统人员带走调查：“因为他这件事情已经涉及到国家安全问题，所以出来以后，我们国家安全系统的人员要去做一些调查研究，也理所当然。”
在王立军被国家安全系统的人带走后，大陆财经类媒体财新《新世纪》周刊2月12日曾报道，王立军8日凌晨离开美领馆时表现“非常平静”，8日被送上飞机带往北京，9日被移交中纪委接受审查。海外中文媒体此后在报道时大多认为王立军应该正在接受中纪委的调查。但此次《南华早报》的报道所援引中纪委副书记马馼的话称王立军案未被移交给中纪委。
值得关注的是，《南华早报》4日的报道援引一个传言称，王立军自己要求国家安全局调查，因为据称薄熙来与中纪委的关系很近(One rumour is that Wang had demanded that his actions be investigated by the Ministry of State Security rather than the disciplinary commission, in which Bo has many close allies)。
不过，有一点也值得注意，《南华早报》2月13日曾报道援引重庆三个独立消息源称，黄奇帆确曾亲自率领大批武警到距离重庆300公里的四川省会成都，包围美国驻成都的领事馆。而近期重庆市政府发言人的表态以及黄奇帆自己的解释均否认了亲率武警赴成都的传言。由此，这份在香港销量最高的报纸的公信力似乎也容易受到质疑。
