国民党在国内战争末期，寄希望于迁都来达到与共产党部队继续抗争下去的目的。蒋介石充分利用川西袍哥的人力和物力来对付共产党。国民党吸收大量袍哥加入到抗拒解放军的武装反抗军，其中尤以五期“游击干部训练班”最甚，学员几乎全是袍哥。袍哥武装不仅仅在四川有，各地成立的反共救国军、游击挺进军等也渗入了相当数量的袍哥分子。
解放战争胜利后，新中国成立，四川地区的国民党残余策划了一次叛乱，刘文辉组织策划执行了这次叛乱，叛乱主力就是袍哥。而刘文辉就是大地主刘文彩的弟弟，刘文彩又是当时当地袍哥的主要干部。
国民党内部并不是很纯粹的军人，其中掺杂着很多反动党团及封建迷信组织。起义后的国民党第7兵团2. 3万人，查出其内部的各类反动、封建组织竟达75种，有4058人参加。川军中的袍哥组织更是门户繁杂。“在第16兵团，兵团副司令、第47军军长和3个团长均系袍哥大爷，全兵团有近半人员参加了袍哥组织。”袍哥范绍增的“国防挺进军”直接就全是活脱脱的一个袍哥武装。
军阀的部队和袍哥组织之间存在着相互渗透、具有交集的关系。袍哥成员参军，军队中又成立袍哥组织。然而，军阀要控制这个庞大的民间社会组织，并不能全然依照军队的纪律来管理。军阀们调度和控制袍哥为己用的方法与最初招募的方法一致，需要因地制宜。那么，“袍哥义气”就成为了一条不成文的军纪了。
军阀头目通过为袍哥组织提供食宿，善待袍哥大爷和主要人物等方式来拉拢和结义，那么袍哥人员按照会规就会以个人性命来为军阀拼取势力范围。每打一次内战就要扩编一次队伍”。上世纪30年代初，在川军30多万的庞大部队中，袍哥所占比例就达到了1/5。
军阀混战虽然致使部分军阀被削弱或终结，但是大军阀如刘文辉、邓锡侯、潘文华、刘湘的力量并未受战争的多大损失。所以40年代时期，袍哥对军队的影响进一步扩大。在新中国成立之初所做的调查中显示，袍哥在川军部队中比例就占到了60%，在个别军中的比例更甚。如邓锡侯部的九十五军“袍哥公开在全军合法存在，仅军直及一百二十六师袍哥成份约占90%，六七三团五连一百一十四人中袍哥有90人，全军7个团长，袍哥大爷即有6人。在全军占统治地位的袍哥势力，袍哥组织成为统治部队的有力工具”。
然而，军队中的军官一样存在袍哥当政的情况。例如军阀田颂尧就是有名的袍哥头目，他就是袍哥的强硬后台。用一件发生在1933年的事情来证明袍哥军阀如何招募袍哥成员入军。时年，田指使其弟田泽孚组织三台、盐亭、间中、苍溪、巴中、通江、绵阳等七县的袍哥组织成立了“武德总社”。田辞职返籍后，即以“武德总社”大爷身份统领这七县袍哥，称霸一方。“总社在成都，支社三十余个，社员达十万人。”袍哥的总人数根据推测可以达到1700万，是名副其实的民国“第一黑帮”。
