中国农历新年临近，台军也藉此加强春节战备，其海军陆战队1月28日首度公开 “高雄港反突击实兵演练”操演，模拟两岸直航后武装人员夺占码头，台军出动单人手持式无人飞行载具、“红隼”近程反装甲火箭夺回码头。台湾联合新闻网称，这是近年台军方首次在反恐演习中，以“解放军利用直航发动突袭”为想定课目。台军方认为，解放军“可利用客机及商船，合法穿越台海上空，进入台属海域进行侦察、渗透和突袭”，甚至猜测大陆可能利用客机和商船搭载军人，上演“木马屠城”。
报道称，台湾海军陆战队28日上午在高雄左营火牛营区海滩进行战力展示。陆战队模拟敌方武装部队约30人潜伏在两岸直航的货轮中，强行停靠高雄港第一货柜中心41号码头，并在下船后袭杀港勤人员、控夺行政大楼及港勤设施，企图夺取高雄港，掩护后续兵力增援，伺机攻击重要目标，策应犯台任务。台陆战 99旅步3营步7连接到作战区电令后，高雄港反突击应变制变计划命令生效，即刻肃清高雄港第一货柜中心41号码头军事武装人员，确保港口和周边地区安全。此次操演课目包括“战备部队集结”“海(陆)上接敌运动”“精准射击”“攻坚扫荡”“战场救护”和“狙击射击”。海军陆战队先是出动单人手持式无人飞行载具进行侦察搜索，无人飞行载具因为体积小具有匿踪特性，不易被敌人发现；接着出动AAV7两栖突击车和AAVC7指挥车，以“红隼”近程反装甲火箭攻击目标，还用狙击枪打下敌人滞空监控地面的无人飞行载具。“中央社”称，单人手持式无人飞行载具以及“红隼”近程反装甲火箭都是首次公开亮相。
如今的解放军已经具备收复台湾的能力
台海军称，陆战99旅平时负责“灾害防救”及“第四作战区战备”任务，战时负责高雄作战分区守备，随时根据命令投入各项作战任务。其具备摩步化作战能力，不受时间、天候与地形影响，加上具备两栖作战能力，可装载于登陆舰船进行两栖突击、外岛应援及规复作战，如搭乘AAV7两栖突击车，便能进行机械化、滨海和渡河作战。同时，还可借运兵直升机执行空中机动与秘密渗透任务。台海军陆战队指挥官陈子凤中将透露，驻防高雄林园的陆战队99旅固定有一个步兵连保持待命，担任高雄港的快速应变部队。这次参演的步3营步7连，就是今年春节期间轮值的待命部队，而位于林口的陆战66旅则负责台北港的应变任务。报道特别提到“狙击射击”这一演练课目，称过去“国军”并不重视狙击手的观念和编制，顶多安排部分官兵组成“射击队”，但近年海军陆战队开始在编制中设置“狙击连”，负责战场狙击与反恐等任务，主要是射杀敌军指挥官。
早在台北101大楼规划阶段，岛内便有影响松山机场航道的讨论，2001年“9·11”恐怖袭击事件后，类似讨论更多。2008年马英九上任后与大陆开启两岸直航，台军方的心态更为复杂，始终放不下安全方面的顾虑。台“国防部”曾公开表示，“两岸直航可能压缩台军现有战备预警及反应时间，切割海、空训练空域，暴露空防战力要点，对台湾安全势必造成影响”。台军方认为，解放军“可利用客机及商船，合法穿越台海上空，进入台属海域进行侦察、渗透和突袭”，甚至猜测大陆可能利用客机和商船搭载军人，上演“木马屠城”，到达台湾的机场或港口后一举“解除台军武装”或攻击要害目标。
《中国时报》直言，台军一直没有停止针对两岸直航的军事准备，各直航机场港口都部署了应变部队，在必要时执行反空降任务；宪兵和陆战特勤队也以反恐、反劫持和反特攻为主要任务，万一真的发生民航机遭劫持状况，台湾防空系统可以轻易掌握飞机动态，采取进一步手段，其中包括迫使遭劫持飞机降落，“是否包括其他手段，属于极为敏感且艰难的决定，相关单位绝对不会对外说明”。文章也承认，两岸直航几年来，除了班机误点外，从未发生更严重的状况，马英九 2014年曾在国民党中常会特别提到这一点，“当年我们主张两岸直航的时候，也有反对党的立委担心大陆民航机过来后面会跟着战斗机……但事实并非如此。”